基本分析的本质是寻找内涵价值与市场价格之间的偏离，并在市场看不见的手下进行套利。

证券作为一种特殊的商品，既有普通商品的性质，也有其独有的特性。

普通商品价格和价值的关系是怎样的呢？社会必要劳动时间或生产使用价值的社会必要劳动时间，决定该商品使用价值的价值量。价格是物化在商品内的劳动的货币名称。随着价值量转化为价格，这种必然的关系就表现为商品同在它之外存在的货币商品的交换比例。这种交换比例既可以表现商品的价值量，也可以表现比它大或小的量，在一定条件下，商品就按这种较大或较小的量来让渡的。商品的价格受供求关系的影响，围绕着价值上下波动。

证券作为一种特殊的商品，其价格与价值的运动规律与普通商品有很大的不同的。

基本分析的理论基础是“价值投资”，它认为：股票的价值决定了其价格，价格是围绕着价值波动的。股票的价值总是被高估或低估，但总有一天价格会回归价值。所以，通过这种价格与价值的背离进行套利。因此，判断股票价格与价值的背离程度至关重要。

基本分析认为股票的内涵价值是由上市公司的内在价值决定的。而上市公司的内在价值又分为两个方面：（1）上市公司所拥有的实物资产与货币资产所体现的最低市场使用价值；（2）上市公司未来的盈利能力。因此，基本分析派分成了“价值股票”投资派和“增长股票”投资派。

“价值股票”投资派对股票价值进行估价时，采用“清偿”的思路，估算当该公司进行市场拍卖时，全部资产的市场价值。这一“清偿”价格被认为是非常接近公司的“内在价值”。“增长股票”投资派则沿袭了“折现”的思路，即公司未来盈利的现在价值构成了公司的市场价值。

无论是“价值股票”投资派还是“增长股票”投资派对上市公司内在价值进行估价的时候，都是“预测上的预测”。“价值股票”投资派评估公司在清偿时的价值，进而评估内在价值是否被高估或低估。“增长股票”投资派则根据上市公司的经营情况对公司未来的经营进行预测，在这个预测值的基础上判断内在价值是否被高估和低估。因此，内在价值是估计值，而不是精确值，并且它必须是在外界条件发生变化时不断调整的估计值。

证券价格围绕着内涵价值线上下波动，基本分析的目的就在于通过分析上市公司的内在价值找到证券的内涵价值线。只是上市公司的内在价值受多种因素的影响，内涵价值线本身也受多种因素影响，价格又围绕着内涵价值线进行波动，价格与价值的偏离方向和度越来越难以判断，价格的运动呈现高度随机的运动状态。基本分析虽然认识到价值与价格的偏离，但却无法准确的判定偏离的度，以及回归的时间。

以基金为首的机构投资者，运用基本分析进行研究是卓有成效的。因为他们相较于普通的投资者有更多的信息优势，研究优势。但也无法做到精准的判定其偏离度及回归时间。

一方面，股票价格回归价值的时间可能会很长，需要有足够的耐心进行长期的投资。并且，必须需要有足够的资金承受过程中的压力。另一方面，回归的时间也可能是非常急促的，必须能迅速反应，做出决策。

期货市场上，商品的供求关系直接影响到期货商品的价格走势。然而对商品供求关系的研究并不是简单的分析某几个因素或某个事件。人们习惯于将价格的涨跌归于某一事件的发生，这其实是一种错觉，价格运动一定是多种因素的合成，除非该事件大到使得其它事件都失去了意义。同时，由于正反馈作用的存在，很小的一个事件可能会被放大许多倍。这是基本分析一直以来无法突破的难题，因为大量的信息，无法判断究竟哪些信息会对价格的运动起主要的影响，并且这些影响最终是促使价格涨还是跌也难以判断。

对积理论针对基本分析应用中的难题，对基本分析提出了新的拓展应用。价格围绕着内涵价值做准周期运动。内涵价值是高度随机波动的，对积理论里没有判断内涵价值线运动的模型。价格和内涵价值虽然有偏离，但内涵价值线对价格始终有一个吸引因子。对积理论的方法是跟随吸引因子。对积理论通过对交易品种自身内涵价值的多空对冲，在每一个内涵价值点上建立既定目标下（既定目标分为多个准则，准则下还可再分准则，不限定，直至分析到无可分解）多空博弈决策矩阵，取得博弈的混合最优解，也就是在当前内涵价值点上的最佳交易决策。不管内涵价值线如何运动，都有相应的交易决策。